Bajo la dirección de un Capitán de Navio es la máxima representación de la Armada en Asturias. La Comandancia Naval de Gijón fue creada en 1800 y tras diferentes emplazamientos portuarios su instalación actual desde 1948 es la calle Claudio Alvargonzález, 20.

Tiene entre sus principales cometidos el poyo a buques de la Armada y marinas de otros países en escalas portuarias, apoyo a buques de la Armada en actividades de vigilancia pesquera y seguridad marítima, apoyo a despliegues de la unidad de buceo de Ferrol para desactivación de artificios y municiones sin explotar, protección del Patrimonio Arqueológico Subacuático, articipación en Comités Consultivos de Protección y Consejos de Navegación de los puertos de Gijón y Avilés, etc.