Creado en 1579 como Tercio de Niño al ser su primer maestre de campo Gabriel Niño de Zúñiga siendo enviado a Porugal. En 1593 como Tercio de Lisboa, 1713 como Regimiento de Infantería Lisboa hasta 1791 en que al ser reorganizado en Zaragona adopta el nombre de Regimiento de Infantería Zaragoza nº 14 con el que participa en la guerra de la Independencia participando en las batallas de Medina de Rioseco, Bailén, Tamames y Alba de Tormes, al finalizar parte del regimiento es enviado a México (1817-21) y a su vuelta es reunificado. Participó en las tres guerras carlistas, un batallón expedicionario fue enviado a Cuba (1896-98) y a la guerra de Marruecos (1921-26) con acciones en la recuperación de Nador, Sagangan, Zeluán y Monte Arruit.

En 1931 con la II República le fue fusionado con el Regimiento Murcia nº 37 y acuartelamiento en Lugo. En la guerra civil participó en las batallas de Alto del León, Aragón, Teruel, Ebro, Cataluña y Extremadura. Al finalizar se reorganiza como Regimiento de Infantería de Montaña nº 30 con cuartel en Ourense, en 1943 recupera el nombre de Regimiento de Infantería de Zaragoza nº 12 con acuartelamiento en Santiago de Compostela, como Agrupación de 1960 a 1963, volviendo a regimiento hasta su disolución en 1965 integrandose su personal en el Regimiento Isabel la Católica nº 29.

El cuartel de San Fernando en Lugo se construyó en 1779 junto a la muralla, de estilo neoclásico con la función inicial de albergar inválidos del ejército, disponía de dos patios uno para inválidos y el otro para un regimiento, actualmente están unidos. Tiene la consideración de Bien de Interés Cultural y es propiedad de la Xunta de Galicia.

En 2016 quedó creado el Regimiento de Infantería Zaragoza n.º 5 de Paracaidistas en el que le son incorporados el personal de la Bandera de Infantería Protegida “Ortiz de Zárate” III (BIPAC III/V)  encuadrado en la Brigada Infantería Ligera Paracaidista “Almogávares” VI manteniendo su Acuartelamiento "Santa Bárbara" (Javali Nuevo, Murcia).