El Ejército del Sur lo conformaron las unidades militares sublevadas en Andalucía y Extremadura quedando a su mando el general de división Gonzalo Queipo de Llano, que estableció su cuartel general en Sevilla. Tras las primeras columnas militares que salieron de Sevilla para alcanzar el máximo de poblaciones posible y con dirección a Madrid, el 2 de octubre de 1936 la primera organización gubernamental creada por Franco la "Junta Técnica del Estado"con sede en Burgos decretó la creación del Ejército del Norte y del Ejército del Sur.

- Mandos:

Coronel Juan Yagüe Blanco, falangista y amigo personal de Primo de Rivera y de los generales Franco y Esteban Infantes, estaba destinado en la Legión en Ceuta dirigiendo la sublevación en esta ciudad. Con las tropas llegadas de África el 2 de agosto partió de Sevilla iniciando la campaña de Extremadura que logró unir los territorios del sur con los del norte donde operaba el general Mola. En noviembre de 1937 quedó al mando del Cuerpo de Ejército Marroquí con el que combatió en los frentes de Aragón y Cataluña.

Coronel Luis Soláns Labedán, estaba destinado en la Agrupación de Cazadores de Melilla deteniendo a su superior el general Manuel Romerales Quintero jefe de la circuncripción de Melilla cosolidando así la sublevación el 17 de julio de 1936. En enero de 1937 ascendido a general quedó al mando de las unidades del ejército nacional en Extremadura (Cuerpo de Ejército de Extremadura) cargo que mantendría durante toda la guerra.

Coronel Francisco de Borbón y de la Torre, primo segundo de Alfonso XIII se encontraba exiliado por haber participado en la Sanjurjada de agosto de 1932. Al producirse la sublevación regresó siéndole asignado el mando del Regimiento de Infantería Pavía n.º 7 participando en la toma de Málaga. Ascendido a general en mayo de 1938 quedó al mando de las unidades que operaban en la provincia de Córdoba

Coronel Pedro Jevenois Labernade, estaba destinado en el Regimiento de Artillería de Costa nº.1. Ascendido a general en mayo de 1938 fue nombrado Comandante general de Artillería del Ejército del Sur.

Comandante José Cuesta Monereo, estaba destinado al Estado Mayor de la II División Orgánica y fue el encargado de dirigir la sublevación e incluso con Queipo de Llano y otros oficiales detener al jefe de la división el general José Fernández de Villa-Abrille. En diciembre de 1936 y ascendido a teniente coronel ocupó el cargo de jefe de Estado Mayor del Ejército del Sur que mantendría durante toda la guerra.

Comandante Manuel Baturone Colombo, destinado en el Regimiento de Infantería Cádiz n.º 33, dirigió en 1937 una columna para la toma de localidades en la provincia de Córdoba destacando en la batalla de Pozoblanco. Al finalizar la guerra fue ascendido a coronel.

- Principales acciones:

- Extremadura:

La llegada de los Regulares y Legionarios desde el Protectorado de Marruecos fue el principal rearme de la sublevación en el sur de España para ello el coronel Yagúe se puso al frente y organizó tres columnas con unos 4.000 hombres que partieron de Sevilla el 2 (coronel Asensio Cabanillas) y 3 de agosto de 1936 (comandante Antonio Castejón y teniente coronel Tella).y que de de forma rápida tomarán el máximo de poblaciones posible en su camino por Extremadura hacia Madrid. Los primeros enfrentamientos importantes los encontraron en Almendralejo el día 6, Sigúenza en día 7 y Mérida el día 10 donde les esperaban más de 2000 hombres entre milicianos, guardias civiles y de Asalto. Tomada Mérida el día 12, las columnas se dirigieron a Badajoz donde desde el día 12 al 14 se producieron los combates previamente con bombardeo aéreo y de artillería, después calle a calle y una vez tomada el día 14 una durísima represión, según algunos historiadores la "matanza de Badajoz" supuso el asesinato de 6.000 personas.

-Jaén y Córdoba:

Llamada como Campaña de la Aceituna se inició el 13 de diciembre con la toma de Bujalance y otras localidades  siendo la principal fuerza de los sublevados la columna compuesta por Regulares y Requetés al mando del comandante Luis Redondo García enfrentándose en Cerro Muriano, Peñarroya Lopera y Porcuna a la XIV Brigada Internacional al mando del general Walter y la  3.ª Brigada Mixta llegados de Madrid. Para el 31 de diciembre los sublevados se hicieron con las riberas del Guadalquivir.

En el Santuario de Nuestra Señora de la Cabeza en la población de Andujar se habían refugiado guardias civiles y sus familias venidos de Jaén. El santuario no había sufrido daños si bien los padres trinitarios habían sido asesinados al producirse la sublevación del 18 de julio. El oficial de mayor rango era el capitán Antonio Reparaz Araujo que el 22 se pasó a bando sublevado, esta noticia probocó la desconfianza en los guardias civiles y el 25 de agosto el ministro de la Gobernación les ordenó entregar sus armas a los milicianos. El 15 de septiembre comenzó el asedio incluso con bombardeo artillero, se cree en su interior había unas 1.200 personas de las cuales 165 guardias y a partir del 9 de octubre recibieron por aire alimentos y munición con cierta asiduidad normalmente por el capitán Carlos Haya sin embargo las tropas de Queipo de Llano no lograron llegar a Andujar al quedar frenados en el frente de Pozoblanco y el 1 de mayo de 1937 los republicanos lograron tomar el santuario. Los guardia civiles fueron detenidos y enviados a prisiones en Valencia y sus familias trasladadas a Viso del Marqués (Ciudad Real).

Para frenar el avance de los sublevados la República envió al valle de los Pedroches varias Brigadas Mixtas, la 86ª que disponía de internacionales y carabineros, la 63ª, la 52ª, la 25ª y la 20ª produciendose fuertes combates en Pozoblanco entre 6 de marzo y el 16 de abril de 1937 lo que supuso la retirada de las columnas nacionales impidiendo liberar el asedio del Santuario de Nuestra Señora de la Cabeza.

- Malaga:

A la vez que los sublevados lograron liberar la ciudad de Granada única población de esa provincia donde tuvo éxito la sublevación, la siguente provincia a tomar era Málaga donde la Armada republicana disponía de su puerto. Los combates se iniciaron con el bombardeo de la ciudad el 13 de enero de 1937 por la aviación italiana y los cruceros Canarias, Almirante Cervera y Baleares,; en días siguientes el coronel Francisco Borbón y de la Torre al mando de unidades italianas CTV, su aviación legionaria y Regulares toma poblaciones importantes como Estepona el 14, San Pedro Alcántara el 15, Marbella el 16. Numerosa población civil por miedo a las represalias partió por la carretera de la costa N-340 hacia Almería "la Desbandá" ante la inminente caída de la ciudad siendo atacados y probocando una gran masacre, se calcula fueron asesinados unas 4.000 personas de las 50.000 (las cifras varían según los historiadores) que formaban la columna civil hacia Almería. El 8 de febrero desde Ronda las tropas franquistas, 9 batallones de Camisas Negras italianas unos 10.000 soldados entraron en Málaga defendida por unos 12.000 milicianos aunque solo con 8.000 fusiles produciendose después una dura represión (en el cementerio de San Rafael se han encontrado fosas comunes con 6.100 cadáveres).

-Almería:

La unidad militar que se sublevó el 21 de julio de 1936 en Almería fue el Batallón de Ametralladoras nº. 3 del cuartel de la Misericordia al mando del teniente coronel Juan Huerta Topete gobernador militar de Almería, el cual hubo de rendirse al quedar superado por la Guardia de Asalto, Guardia Civil, Carabineros y la llegada del destructor Lepanto tras diversos enfrentamientos en la ciudad y en otras poblaciones cercanas. Huerta fue detenido y con un peso a los piés arrojado al mar. Derrotada la sublevación se creó el Comité Central Antifascista con sede en el Casino Cultural e inició una fuerte represión con la quema de iglesias, detención y fusilamiento o ahogamiento en alta mar de religiosos, falangistas y personas de derechas. Se calcula fueron cerca de 700 los asesinados en la provincia y de ellos 105 sacerdotes.

Como el resto de ciudades del Mediterráneo había sufrido de los bombardeos aéreos de la Aviación Legionaria italiana desde su base en Mallorca. Para proteger a la población se construyeron una série de refúgios antiaéreos similares a los de Barcelona y bajo la dirección del arquitecto Guillermo Langle. Sin embargo el más duro fue el producido el 31 de mayo de 1937 a las 7,30 horas por una flotilla alemana compuesta por el acorazado de bolsillo Admiral Scheer y cuatro destrúctores: el Albatros, Leopard, Seeadler y Lluchs con 275 disparos afectó a 35 edificios probocando unos 50 muertos. 

La proximidad de tropas franquistas y la llegada del cañonero Cánovas del Castillo la mañana del 29 de marzo de 1939 forzó al gobernador militar Urbano Orad de la Torre a entregar la plaza