Después de su victoria en la batalla de la isla Terceira, el 26 de julio de 1582, Álvaro de Bazán, afianzado en su base de Lisboa, preparó una invasión anfibia de las Azores de gran envergadura. No obstante, no descuidó las pequeñas islas del archipiélago y los reductos resistentes.

El 30 de julio, Pedro de Toledo Osorio zarpó de Angra con doce galeras, cuatro pataches y dieciséis pinazas, en las que iban embarcados dos mil infantes​, con la misión de tomar la isla de Fayal, donde oponían resistencia entre cuatrocientos y quinientos soldados franceses e ingleses, con apoyo de los isleños. Don Pedro de Toledo envió un emisario para negociar con las tropas extranjeras, pero el comandante portugués, António Guedes de Sousa, lo asesinó.​ Los infantes españoles desembarcaron, tomaron y rindieron el Fuerte de Santa Cruz. A los franceses y a los ingleses se les ofrecieron las mismas condiciones de rendición que a sus compatriotas de la isla Terceira.