El estado de Guinea Ecuatorial obtubo su independencia de España el 12 de octubre de 1968 conociendose anteriormente como Guinea Española y hasta 1926 como Territorios Españoles del Golfo de Guinea abarcando el territorio continental de Rio Muni y las islas de Fernando Poo (actual Bioko donde se encuentra la capital del país Malabo, antigua Santa Isabel), Elobey, Annobón y Corisco. La zona fue descubierta para los europeos por el navegante portugués Fernando Poo convirtiéndose en un lugar para la captura de esclavos por portugueses, ingleses y neerlandeses. Mediante el Tratado de El Pardo, en compensación por otros territorios en América, Portugal cedió la soberanía a España en 1778 enviando Carlos III un pequeño contingente naval tomando posesión que no sería efectiva realmente hasta 1843 recibiendo hasta entonces asentamientos ingleses con pretensión de tomarla o comprarla y de negreros españoles. En enero de 1843 se envió al capitán de fragata Juan José Lerena y Barry al mando del bergantín Nervión con el cargo de comisario regio para asentar la colonización donde nombró gobernadores en Fernando Poo y Annobón así como el acuerdo con el jefe nativo Bonkoro por el cual se aplicaba la Constitución de 1837 reconociéndoles la nacionalidad española enviandose en años sucesivos expediciones con jesuitas, ex-esclavos de Cuba y trabajadores españoles con oficios si bien con poco éxito colonial salvo la creación de plantaciones de cacao.

No fue hasta 1914 como consecuencia de la 1ª Guerra Mundial en la que España se declaró neutral que no se establecieron en el interior de Riu Muni una presencia militar de Infantería de Marina creando 4 destacamentos en Mibonde, Mikomeseng, Mongomo y Ebibeyín al estar rodeada de colonias alemanas. En 1956 se organizó como Región Ecuatorial Española con dos provincias: Fernando Poo y Riu Muni con un gobernador general con poderes políticos y militares realizándose unas elecciones en 1960 siendo elegidos procuradores en Cortes así como una Asamblea General y Consejo de Gobierno Autónomo que daría origen bajo supervisión de la ONU a la independencia en 1968.

La Guardia Territorial de la Región Ecuatorial tuvo su origen en una incipiente Policía Indígena creada en 1904 quedando ya instaurada como Guardia Colonial de los Territorios Españoles del Golfo de Guinea en 1907 con misiones militares, policiales y aduaneras al mando de un capitán, tenientes, sargentos y cabos procedentes de la Guardia Civil y 320 guardias nativos haciendo un total de 430 hombres en sustitución del batallón de Infantería de Marina que había estado presente desde 1868. El armamento asignado era el fusil Máuser de 1895 y los oficiales la pistora Astra 1921. La plantilla se fue aumentando a medida que se extendieron por el territorio llegando por ejemplo en 1927 a estar bajo el mando de un teniente coronel con 5 compañías territoriales y una móvil esta para la vigilancia de las fronteras con Camerún y Gabón (que pasaron a ser dos en 1961). En 1946 se permitió a oficiales de los tres ejércitos integrarse si de forma voluntária así lo solicitasen, en 1956 se adoptó el nombre de Guardia Territorial de la provincia de Guinea y en 1959 como Guardia Territorial de la Región Ecuatorial siendo incorporados los primeros oficiales indígenas formados en la Academia General Militar de Zaragoza (10) y en la Academia Especial Militar de Villaverde (2) siendo uno de ellos el que sería presidente Teodoro Obiang N’Guema y actualizando el armamento con la pistorla Star 1940, subfusil Star Z-45, fusil CETME modelo B, ametralladoras ligeras ALFA 1955, lanzagranadas Instalaza modelo 1958, morteros Esperanza y Cia de 81 mm. y granadas tipo PO I y PO II. Su existencia finalizó con la entrega de poderes por motivo de la independencia el 12 de octubre de 1968 a la nueva Guardia Nacional iniciandose los meses posteriores graves tensiones internas que motivó por prevención la Operación Ecuador el 5 de abril de 1969 para la salida de instrúctores militares españoles y personal civil hacia Canarias y después Cádiz.