El cuartel del Príncipe de Asturias se construyó en un solar que había sido un convento franciscano desde mitad del siglo XV, con la desamortización de 1836 y dado su mal estado fue demolido y construido en 1859 un cuartel de Caballería. Su acceso principal es por la Plaza de San Diego.

Junto al del Príncipe y en 1860 se construyó sobre unos terrenos que antes fueron los colegios de San Bernardo (cisterciense) y de Santa Balbina el cuartel de Lepanto para ser la Escuela de Herradores del Ejército. Su acceso principal es por la calle Colegios

Ambos cuarteles se construyeron bajo la dirección del Coronel Comandante León Benigno de Gámiz y del ingeniero militar Francisco Javier del Valle. La construcción está basada en el ladrillo, hierro y acero en los forjados, esquinas de piedra caliza y la clásica distribución cuartelaria con amplio patio central con pabellones de oficiales, administrativos y patios de menor tamaño con pabellones para la tropa y cuadras.

En 2005 Defensa los cedió a la Universidad de Alcalá iniciándose un proceso de reformas en sus 45.000 metros cuadrados siendo el Príncipe ahora llamado Edificio Cisneros desde 2014 la Biblioteca Central de Humanidades y dependencias para seminarios.
En noviembre de 2016 se inauguró en los bajos el Museo de Arte Iberoamericano de la Universidad de Alcalá y en el antiguo cuartel de Lepanto se están realizando las obras para su rehabilitación de lo que será residencia de estudiantes.

La última Unidad militar destinada fue la Brigada Paracaidista (BRIPAC) que alojó allí su primera bandera de infantería Roger de Flor, el grupo de artillería de campaña (GACAPAC) y el grupo logístico de lanzamiento y apoyo.
La Roger de Flor" I/4 se creó el 17 de octubre de 1953 con base en estos cuarteles intervino en acciones en la guerra de Ifni (1957), Sahara (1961 y 1963) a sí como en el conflicto de la Marcha Verde de 1975.

Desde 1998 tiene su cuartel en la Base "Príncipe" en Paracuellos de Jarama (Madrid) habiendo participado en misiones internacionales en Irak (1990) y de la ONU en Yugoslavia y Bosnia-Herzegovina entre otras.